Depuis sa création, l’ISET a associé les industriels et les organisations professionnelles de la région à l’élaboration des référentiels des formations mises en place et ceci dont le but de réussir l’adéquation formations et besoins des entreprises en métiers et compétences. Cette démarche lui a permis au fil des années- jusqu’au mois de juin 2008- de mettre en place huit filières, soit 8 départements, répondant aux attentes du marché de l’emploi :
La durée des études était de cinq semestres, quatre étaient réservés aux enseignements théoriques et pratiques alors que le 5ème était consacré à la réalisation du Projet de Fin d'Etudes, se déroulant le plus souvent dans une entreprise. De plus, l'étudiant était appelé à effectuer deux stages en entreprise d’un mois chacun.
Suite à l’adhésion des ISET’s au nouveau système de l’enseignement supérieur (LMD), une restructuration des départements et par conséquent des filières à été réalisée au mois de juin 2008 pour une meilleur gouvernance de l’institut et une meilleur adaptation au nouveau système. Ainsi, le nombre de départements a été ramené à quatre :
- Génie Mécanique
- Génie Electrique
- Technologies de l’Informatique
- Sciences Economiques et de Gestion
Ces départements ont été appelés à mettre en place des licences à caractère appliqué en accord avec la mission qui a été assignée à l’ISET dès sa création. Ainsi, quatre licences ont été mise en place dès la rentrée de septembre 2008 :
Une licence co-construite a été créée, (L3) en Gestion des Centres d’Hydrothérapie au cours de l’année 2008/09.
La démarche adoptée lors de la mise en place des anciennes filières, à savoir l’implication des professionnels dans l’élaboration des différents référentiels a été de nouveau mise en œuvre afin de garantir l’adéquation formations et besoins de l’entreprise en personnel qualifié.